AT5G41480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Folylpolyglutamate synthetase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a dihydrofolate synthetase based on yeast complementation experiments. This protein is involved in folate biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GLOBULAR ARREST1 (GLA1); FUNCTIONS IN: dihydrofolate synthase activity; INVOLVED IN: one-carbon metabolic process, embryo development ending in seed dormancy; LOCATED IN: mitochondrial matrix; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mur ligase, central (InterPro:IPR013221), Folylpolyglutamate synthetase, conserved site (InterPro:IPR018109), Mur ligase, C-terminal (InterPro:IPR004101), Folylpolyglutamate synthetase (InterPro:IPR001645); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DHFS-FPGS homolog B (TAIR:AT5G05980.2); Has 8245 Blast hits to 8243 proteins in 2505 species: Archae - 47; Bacteria - 5105; Metazoa - 156; Fungi - 354; Plants - 131; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2452 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:16595967..16598523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56907.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 530 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRTLWNHFST ISYIKISPRM RRISAANLIS NRNLSTISST EDPELRDFVG FLESLKNYEK SGVPKGAGTD SDDGFDLGRM KRLMLRLRNP HYKYKVVHVA 101: GTKGKGSTSA FLSNILRAGG YSVGCYSSPH ILSIKERISC NGEPVSASTL NDLFYSVKPI LEQSIQEENG SLSHFEILTG IAFSLFEKEN VDIAVIEAGL 201: GGARDATNVI ESSNLAASVI TTIGEEHMAA LGGSLESIAE AKSGIIKHGR PVVLGGPFLP HIEGILRSKA ASVSSSVILA SNIGSSSSIK GIINKNGIGL 301: CQSCDIVIQN EKDDQPIVEL SDVNLRMLGH HQLQNAVTAT CVSLCLRDQG CGRVTDEAIR IGLENTRLLG RSQFLTPKEA ETLLLPGATV LLDGAHTKES 401: ARALKEMIKK DFPEKRLVFV VAMASDKDHV SFAKELLSGL KPEAVILTEA DIGGGKIRST ESSVLKESWI KAADELGSRS MEASENKTVL GSLKLAYKIL 501: SDDTTSSDSG MVIVTGSLHI VSSVLASLQH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)