ATMG00516.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NADH dehydrogenase 1C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes subunit of mitochondrial NAD(P)H dehydrogenase that is trans-spliced from three precursors, NAD1A, NAD1B, and NAD1C. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NADH dehydrogenase 1C (NAD1C); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1 (InterPro:IPR001694), NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site (InterPro:IPR018086); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NADH dehydrogenase 1A (TAIR:ATMG01275.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrM:-:143219..147048 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35677.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 325 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: TYIAVPAEIL GIILPLLLGV AFLVLAERKV MAFVQRRKGP DVVGSFGLLQ PLADGSKLIL KEPISPSSAN FFLFRMAPVA TFMLSLVARA VVPFDYGMVL 101: SDPNIGLLYL FAISSLGVYG IIIAGRSSNS KYAFLGALRS AAQMVSYEVS IGLILITVLI CVGPRNSSEI VMAQKQIWSG IPLFPVLVMF LISRLAETNR 201: APFDLPEAEA ESVAGYNVEY SSMGSALFFL GEYANMILMS GPCTLFFPGG WPPILDLPIF KKIPGSIWFS IKVLLFLFLY IWVRAAFPRY RYDQLMGLGR 301: KVFLPLSLAR VVPVSGLLVT FQWLP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)