AT5G67360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Subtilase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a subtilisin-like serine protease essential for mucilage release from seed coats. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ARA12; FUNCTIONS IN: serine-type endopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, seed coat development, mucilage metabolic process involved seed coat development, mucilage extrusion from seed coat; LOCATED IN: extracellular region, apoplast, cell wall, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 17 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease-associated PA (InterPro:IPR003137), Proteinase inhibitor, propeptide (InterPro:IPR009020), Peptidase S8/S53, subtilisin/kexin/sedolisin (InterPro:IPR000209), Peptidase S8, subtilisin-related (InterPro:IPR015500), Peptidase S8/S53, subtilisin, active site (InterPro:IPR022398), Proteinase inhibitor I9, subtilisin propeptide (InterPro:IPR010259); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Subtilase family protein (TAIR:AT2G05920.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26872192..26874465 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 79419.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 757 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSSFLSSTA FFLLLCLGFC HVSSSSSDQG TYIVHMAKSQ MPSSFDLHSN WYDSSLRSIS DSAELLYTYE NAIHGFSTRL TQEEADSLMT QPGVISVLPE 101: HRYELHTTRT PLFLGLDEHT ADLFPEAGSY SDVVVGVLDT GVWPESKSYS DEGFGPIPSS WKGGCEAGTN FTASLCNRKL IGARFFARGY ESTMGPIDES 201: KESRSPRDDD GHGTHTSSTA AGSVVEGASL LGYASGTARG MAPRARVAVY KVCWLGGCFS SDILAAIDKA IADNVNVLSM SLGGGMSDYY RDGVAIGAFA 301: AMERGILVSC SAGNAGPSSS SLSNVAPWIT TVGAGTLDRD FPALAILGNG KNFTGVSLFK GEALPDKLLP FIYAGNASNA TNGNLCMTGT LIPEKVKGKI 401: VMCDRGINAR VQKGDVVKAA GGVGMILANT AANGEELVAD AHLLPATTVG EKAGDIIRHY VTTDPNPTAS ISILGTVVGV KPSPVVAAFS SRGPNSITPN 501: ILKPDLIAPG VNILAAWTGA AGPTGLASDS RRVEFNIISG TSMSCPHVSG LAALLKSVHP EWSPAAIRSA LMTTAYKTYK DGKPLLDIAT GKPSTPFDHG 601: AGHVSPTTAT NPGLIYDLTT EDYLGFLCAL NYTSPQIRSV SRRNYTCDPS KSYSVADLNY PSFAVNVDGV GAYKYTRTVT SVGGAGTYSV KVTSETTGVK 701: ISVEPAVLNF KEANEKKSYT VTFTVDSSKP SGSNSFGSIE WSDGKHVVGS PVAISWT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)