AT5G65720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nitrogen fixation S (NIFS)-like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cysteine desulfurase whose activity is dependent on AtSufE activation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
nitrogen fixation S (NIFS)-like 1 (NFS1); FUNCTIONS IN: transaminase activity, zinc ion binding, cysteine desulfurase activity, ATP binding; INVOLVED IN: iron-sulfur cluster assembly; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Cysteine desulfurase (InterPro:IPR010240), Aminotransferase, class V/Cysteine desulfurase (InterPro:IPR000192), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421), Cysteine desulfurase, NifS (InterPro:IPR016454); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: chloroplastic NIFS-like cysteine desulfurase (TAIR:AT1G08490.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:26296349..26297710 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50298.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 453 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASKVISATI RRTLTKPHGT FSRCRYLSTA AAATEVNYED ESIMMKGVRI SGRPLYLDMQ ATTPIDPRVF DAMNASQIHE YGNPHSRTHL YGWEAENAVE 101: NARNQVAKLI EASPKEIVFV SGATEANNMA VKGVMHFYKD TKKHVITTQT EHKCVLDSCR HLQQEGFEVT YLPVKTDGLV DLEMLREAIR PDTGLVSIMA 201: VNNEIGVVQP MEEIGMICKE HNVPFHTDAA QAIGKIPVDV KKWNVALMSM SAHKIYGPKG VGALYVRRRP RIRLEPLMNG GGQERGLRSG TGATQQIVGF 301: GAACELAMKE MEYDEKWIKG LQERLLNGVR EKLDGVVVNG SMDSRYVGNL NLSFAYVEGE SLLMGLKEVA VSSGSACTSA SLEPSYVLRA LGVDEDMAHT 401: SIRFGIGRFT TKEEIDKAVE LTVKQVEKLR EMSPLYEMVK EGIDIKNIQW SQH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)