AT5G64000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.958 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Inositol monophosphatase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
SAL2; FUNCTIONS IN: 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase activity, inositol or phosphatidylinositol phosphatase activity; INVOLVED IN: sulfur metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 15 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inositol monophosphatase (InterPro:IPR000760), 3(2),5 -bisphosphate nucleotidase HAL2 (InterPro:IPR006239), Inositol monophosphatase, metal-binding site (InterPro:IPR020583); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Inositol monophosphatase family protein (TAIR:AT5G09290.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25616664..25618478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37510.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 347 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSYEKELAAA KKAVTLAARL SQEVQKTLLQ SQVWKKSDRS PVTAADYGSQ AVVSLVLERE LQPDKLSLVA EEETGDLRKN GSEAFLEDIA KLVKDTLASE 101: ESYTSSPLST DDVLNAIDCG KSEGGCKGSH WVLDPIDGTR GFVRGEQYAV GLALLVEGKV VLGVMACPNL PLASAVCATD NSSQEDVGCL FFATTGSGTY 201: VQSLKGNSLP QKVQVSSNEN LDEAKFLESY HKPIPIHGTI AKKLGIKALP VRIDSQAKYA ALSRGDAEIY LRFTLNGYRE CIWDHAPGSI ITTEAGGVVC 301: DATGKSLDFS KGKYLAHKTG IIVTTKKLKP WILKAVRESI EEENLYF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)