AT5G61810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mitochondrial substrate carrier family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Mitochondrial substrate carrier family protein; FUNCTIONS IN: binding, calcium ion binding; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: mitochondrial inner membrane, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), Mitochondrial carrier protein (InterPro:IPR002067), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mitochondrial substrate carrier family protein (TAIR:AT5G07320.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:24831843..24833735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53278.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 478 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAEKSKQNP GKKPVEATME HVLVALRETK EKREIRIQKL FEFFDNSKLG FLDDTQIEKG LSSLSIPPKY RYASDFLKVC DSNRDGRVDY QEFRRYMDAK 101: ELELYKIFQA IDIEHNGDIC PAELWEALDK AGIKIKDEEL ASFMEHVDKD NNGIITFEEW RDFLLLNPHE ATIENIYHHW ERVCLIDIGE QAVIPDGISA 201: HAQRSKLLLA GGIAGAVSRT ATAPLDRLKV ALQVQRTNLG VVPTIKKIWR EDKLLGFFRG NGLNVAKVAP ESAIKFAAYE MLKPIIGGAD GDIGTSGRLL 301: AGGLAGAVAQ TAIYPMDLVK TRLQTFVSEV GTPKLWKLTK DIWIQEGPRA FYRGLCPSLI GIIPYAGIDL AAYETLKDLS RAHFLHDTAE PGPLIQLGCG 401: MTSGALGASC VYPLQVIRTR MQADSSKTSM GQEFLKTLRG EGLKGFYRGI FPNFFKVIPS ASISYLVYEA MKKNLALD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)