AT5G61560.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.760 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : U-box domain-containing protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
U-box domain-containing protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: ubiquitin-protein ligase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, protein ubiquitination, response to stress; LOCATED IN: chloroplast, plasma membrane; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UspA (InterPro:IPR006016), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), U box domain (InterPro:IPR003613), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: U-box domain-containing protein kinase family protein (TAIR:AT4G25160.1); Has 112471 Blast hits to 110615 proteins in 4538 species: Archae - 130; Bacteria - 13122; Metazoa - 41054; Fungi - 8748; Plants - 32669; Viruses - 288; Other Eukaryotes - 16460 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:24753476..24756506 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 90228.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 796 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGDGALIVAV AIKGNNSKTK GVVRWALQEF ASQEHVVFKL LHVQPRDSNS VSTTRKDLTT SVYKKDVDRK TREMLLPSRD MFVHREVQLD IMVLESDDIA 101: DAISKAVQDH GISELVIGAS SSIIFSWKLK RSNLSSRIAD ATPRFCSVHV ISKGKLLNVR KSDMDTETSI ADDRSESRFS SDSHSGTVSS TSSHQFSSTP 201: LLFQRIQALT TVNQKVGTNI GKQNNEPHHH HHNRAGSLDV DESKLLNQKG FYRTSSSGIG YGGSDISSWR SSQMEEASSS STYSDPTSSS SQIHKDFELE 301: KLKIELRHIK GMYAVAQSEV IDASKKMQDL NQRRSEEATR LKNLTIREEE ADEVVEMERE RQEDAENEAE LVRECIERET EERLEAEARA EEVRKEKQRL 401: EDALEGGPLQ RQQYMKFEWE EIVEATSSFS DELKIGVGGY GSVYRCNLHH TTVAVKVLHS DKSSLTKQFH QELEILSKIR HPHLLLLLGA CPERGSLVYE 501: YMHNGSLEER LMKRRPNVDT PQPPPLRWFE RFRIAWEIAS ALYFLHTNEP RPIVHRDLKP ANILLDRNNV SKIGDVGLSK MVNLDPSHAS TVFNETGPVG 601: TFFYIDPEYQ RTGVVTPESD IYAFGIILLQ LVTARSAMGL AHSIEKALRD QTGKFTEILD KTAGDWPVKE AKEMVMIGLR CAEMRKRDRP DLGKEILPVL 701: ERLKEVASIA RNMFADNLID HHHNAPTHFY CPITKDVMEN PCVASDGYTY EKRAIKEWLQ KNHKSPMTDL PFPSDSLLPN HSLLSAIKEW RSQLIK |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)