AT5G59670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT5G59680.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:24041538..24045478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 97037.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 868 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESSFGLLLA LLTLTIIHIV QAQDPQGFIS LDCGLPANET SPYTETQTGL LFSSDATFIQ SGKTGRVQAN QESKFLKPYR TLRYFPEGVR NCYNLSVFKE 101: RKYLIAASFL YGNYDGHNIA PVFDLYLGPN LWAKIDLQDV NGTGEEILHI PTSNSLQICL VQTGETTPLI SSLELRPMRT GSYTTVSGSL KTYRRLYFKK 201: SGSRLRYSKD VYDRSWFPRF MDEWTQISTA LGVINTNIYQ PPEDALKNAA TPTDASAPLT FKWNSEKLDV QYYFYAHYAE IQDLQANDTR EFNILLNGQN 301: LSVTGPEVPD KLSIKTFQSS SPISCNGWAC NFQLIRTKRS TLPPLLNALE VYTVIQFPRS ETDESDVVAM KNISASYGLS RINWQGDPCF PQQLRWDALD 401: CTNRNISQPP RITSLNLSSS RLNGTIAAAI QSITQLETLD LSYNNLTGEV PEFLGKMKSL SVINLSGNNL NGSIPQALRK KRLKLYLEGN PRLIKPPKKE 501: FPVAIVTLVV FVTVIVVLFL VFRKKMSTIV KGLRLPPRTS MVDVTFSNKK SKRFTYSEVV QVTKNFQRVL GKGGFGMVYH GTVKGSEQVA VKVLSQSSTQ 601: GSKEFKAEVD LLLRVHHTNL VSLVGYCCEG DYLALVYEFL PNGDLKQHLS GKGGNSIINW SIRLRIALEA ALGLEYLHIG CTPPMVHRDV KTANILLDEN 701: FKAKLADFGL SRSFQGEGES QESTTIAGTL GYLDPECYHS GRLGEKSDVY SFGIVLLEMI TNQPVINQTS GDSHITQWVG FQMNRGDILE IMDPNLRKDY 801: NINSAWRALE LAMSCAYPSS SKRPSMSQVI HELKECIACE NTGISKNRSL EYQEMNVSLD TTAVPMAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)