AT5G59220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : highly ABA-induced PP2C gene 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
highly ABA-induced PP2C gene 1 (HAI1); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: response to water deprivation, response to abscisic acid stimulus; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein phosphatase 2C-related (InterPro:IPR001932), Protein phosphatase 2C (InterPro:IPR015655), Protein phosphatase 2C, N-terminal (InterPro:IPR014045); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: highly ABA-induced PP2C gene 2 (TAIR:AT1G07430.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:23894672..23896497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45540.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 413 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEICYENET MMIETTATVV KKATTTTRRR ERSSSQAARR RRMEIRRFKF VSGEQEPVFV DGDLQRRRRR ESTVAASTST VFYETAKEVV VLCESLSSTV 101: VALPDPEAYP KYGVASVCGR RREMEDAVAV HPFFSRHQTE YSSTGFHYCG VYDGHGCSHV AMKCRERLHE LVREEFEADA DWEKSMARSF TRMDMEVVAL 201: NADGAAKCRC ELQRPDCDAV GSTAVVSVLT PEKIIVANCG DSRAVLCRNG KAIALSSDHK PDRPDELDRI QAAGGRVIYW DGPRVLGVLA MSRAIGDNYL 301: KPYVISRPEV TVTDRANGDD FLILASDGLW DVVSNETACS VVRMCLRGKV NGQVSSSPER EMTGVGAGNV VVGGGDLPDK ACEEASLLLT RLALARQSSD 401: NVSVVVVDLR RDT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)