AT5G58270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ABC transporter of the mitochondrion 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a mitochondrial half-molecule ABC transporter, a member of ATM subfamily. Mutants are dwarfed, chlorotic plants with altered leaf morphology. ATM3 transcription is induced by Cd(II) or Pb(II). Involved in heavy metal resistance. Arabidopsis thaliana has three ATM genes, namely ATM1, ATM2 and ATM3. Only ATM3 has an important function for plant growth. Role in Moco biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ABC transporter of the mitochondrion 3 (ATM3); FUNCTIONS IN: ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances, transporter activity; INVOLVED IN: in 9 processes; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ABC transporter-like (InterPro:IPR003439), ABC transporter, transmembrane domain, type 1 (InterPro:IPR011527), ABC transporter integral membrane type 1 (InterPro:IPR017940), ABC transporter, transmembrane domain (InterPro:IPR001140), ABC transporter, conserved site (InterPro:IPR017871); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ABC transporter of the mitochondrion 1 (TAIR:AT4G28630.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:23562168..23567040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 80424.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 728 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSRGSRFVRA PGLLLCRVNL QPQPKIPSFS YSLRSDYRLH NGFSNYIRRN SIRTSPVINA FLSDNSPSPS PSPSPIRFVQ RSSMLNGRLF STSTPNPDQT 101: TTKTKEIKTT SSDSDSAMAD MKILRTLAGY LWMRDNPEFR FRVIAALGFL VGAKVLNVQV PFLFKLAVDW LASATGTGAS LTTFAATNPT LLTVFATPAA 201: VLIGYGIART GSSAFNELRT AVFSKVALRT IRSVSRKVFS HLHDLDLRYH LSRETGGLNR IIDRGSRAIN FILSAMVFNV VPTILEISMV SGILAYKFGA 301: AFAWITSLSV GSYIVFTLAV TQWRTKFRKA MNKADNDAST RAIDSLINYE TVKYFNNEGY EAEKYDQFLK KYEDAALQTQ RSLAFLNFGQ SIIFSTALST 401: AMVLCSQGIM NGQMTVGDLV MVNGLLFQLS LPLNFLGSVY RETIQSLVDM KSMFQLLEEK SDITNTSDAK PLVLKGGNIE FENVHFSYLP ERKILDGISF 501: VVPAGKSVAI VGTSGSGKST ILRMLFRFFD TDSGNIRIDG QDIKEVRLDS LRSSIGVVPQ DTVLFNDTIF HNIHYGRLSA TEEEVYEAAR RAAIHETISN 601: FPDKYSTIVG ERGLKLSGGE KQRVALARTF LKSPAILLCD EATSALDSTT EAEILNALKA LASNRTSIFI AHRLTTAMQC DEIVVLENGK VVEQGPHDEL 701: LGKSGRYAQL WTQQNSSVDM LDAAIKLE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)