AT5G51700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : protein binding;zinc ion binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a resistance signalling protein with two zinc binding (CHORD) domains that are highly conserved across eukaryotic phyla. Mutant has reduced RPS5 and RPM1 mediated resistance. Potentially involved in transduction of R gene mediated disease resistance. Required for R protein accumulation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PPHB SUSCEPTIBLE 2 (PBS2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cysteine/histidine-rich domain (InterPro:IPR007051); Has 933 Blast hits to 477 proteins in 168 species: Archae - 0; Bacteria - 18; Metazoa - 449; Fungi - 191; Plants - 188; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 87 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:21001373..21003143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24962.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 226 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEVGSATKKL QCQRIGCNAM FTDDDNPQGS CQFHASGPFF HDGMKEWSCC KQRSHDFSLF LEIPGCKTGK HTTEKPVLAK SVPKHPVAAP TSSPDANAAT 101: KDSCSRCRQG FFCSDHGSQP KEQIKQTLNT PGQAEEEKIE PLAPPVQKAV IDINQPQVCK NKGCGQTFKE RDNHETACSH HPGPAVFHDR LRGWKCCDVH 201: VKEFDEFMEI PPCTKGWHSS SPDPAV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)