AT5G50960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nucleotide binding protein 35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Highly similar to Saccharomyces cerevisiae NBP35, locus YGL091C. Cytosolic protein that homodimerizes and can assemble both 4Fe-4S - type and 2Fe-2S - type clusters on its amino terminal and carboxy therminal respectively. Null mutants are embryo lethal. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
nucleotide binding protein 35 (NBP35); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mrp, conserved site (InterPro:IPR000808), ATPase-like, ParA/MinD (InterPro:IPR019591); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: IND1(iron-sulfur protein required for NADH dehydrogenase)-like (TAIR:AT4G19540.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:20734267..20735824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37308.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 350 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENGDIPEDA NEHCPGPQSE SAGKSDSCAG CPNQEACATA PKGPDPDLVA IAERMSTVKH KILVLSGKGG VGKSTFSAQL SFALAGMDHQ VGLMDIDICG 101: PSIPKMLGLE GQEIHQSNLG WSPVYVEDNL GVMSIGFMLP NSDEAVIWRG PRKNGLIKQF LKDVYWGEID YLVVDAPPGT SDEHISIVQY LLPTGIDGAI 201: IVTTPQEVSL IDVRKEVSFC KKVGVPVLGV VENMSGLSQP LKDVKFMKLA TETGSSINVT EDVIACLRKN APELLDIVAC SEVFDSSGGG AERMCREMGV 301: PFLGKVPMDP QLCKAAEQGK SCFEDNKCLI SAPALKSIIQ KVVPSTVMTE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)