AT5G50810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : translocase inner membrane subunit 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a small zinc finger-like protein that is a component of the mitochondrial protein import apparatus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
translocase inner membrane subunit 8 (TIM8); FUNCTIONS IN: P-P-bond-hydrolysis-driven protein transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: protein targeting to mitochondrion, protein import into mitochondrial inner membrane; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial inner membrane, mitochondrial intermembrane space; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial inner membrane translocase complex, Tim8/9/10/13-zinc finger-like (InterPro:IPR004217); Has 688 Blast hits to 688 proteins in 171 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 361; Fungi - 183; Plants - 116; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 28 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:20675875..20676505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 8750.63 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 77 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MDPSMANNPE LLQFLAQEKE RAMVNEMVSK MTSVCWDKCI TSAPGSKFSS SESSCLTHCA QRYMDMSMII MKRFNSQ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)