AT5G50210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : quinolinate synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an Fe-S binding protein with quinolinate synthase (QS) activity and cysteine desulfurase activator activity. The QS activity was demonstrated by functional complementation of corresponding E. coli mutants and complementation of embryo-lethal phenotypes of the QS homozygous null allele in Arabidopsis. The SufE domain of the protein also stimulates the cysteine desulfurase activity of CpNifS (AT1G08490) in vitro. This protein binds a (4Fe-Su)2+ cluster in its NadA domain and is localized in the chloroplast. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
quinolinate synthase (QS); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Fe-S metabolism associated SufE (InterPro:IPR003808), Quinolinate synthetase A (InterPro:IPR003473); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfur E2 (TAIR:AT1G67810.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:20442803..20445706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 78938.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 718 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALALSVAPT SSSLSSLLSR TPNPSPNFRT THLNFGSQRR IYTINPLLRS FKCLQSSSRD VNASPFSISA IASSSSSSQT TELVPYKLQR LVKEFKSLTE 101: PIDRLKWVLH YASLLPQMPE SSKTESNRVM GCTARVWLDA ELGQDGKMRF CADSDSDVSK GMCSCLIQVL DEASPVEVME LKTEDLAELN VGLLGGERSR 201: VNTWYNVLVS MQKKTRRLVA EREGKVPSFE PFPSLVLTAH GIEAKGSFAQ AQAKYLFPEE SRVEELVNVL KEKKIGVVAH FYMDPEVQGV LTAAQKHWPH 301: ISISDSLVMA DSAVTMAKAG CQFITVLGVD FMSENVRAIL DQAGFEKVGV YRMSDETIGC SLADAASAPA YLNYLEAASR SPPSLHVVYI NTSLETKAFA 401: HELVPTITCT SSNVVQTILQ AFAQMPELTV WYGPDSYMGA NIVKLFQQMT LMTNEEIANI HPKHSLDSIK SLLPRLHYFQ EGTCIVHHLF GHEVVERIKY 501: MYCDAFLTAH LEVPGEMFSL AMEAKKREMG VVGSTQNILD FIKQKVQEAV DRNVDDHLQF VLGTESGMVT SIVAVIRSLL GSSANSKLKV EVVFPVSSDS 601: MTKTSSDSSN SIKVGDVALP VVPGVAGGEG CSIHGGCASC PYMKMNSLSS LLKVCHKLPD LENVYGGFIA ERFKRQTPQG KLIADVGCEP ILHMRHFQAN 701: KELPDKLVHQ VLSCESKR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)