AT5G49970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pyridoxin (pyrodoxamine) 5'-phosphate oxidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes the bifunctional pyridoxine (pyridoxamine) 5?-phosphate oxidase (PPOX)(EC 1.4.3.5) that is involved in the formation of pyridoxal 5'-phosphate (member of the vitamin B6 group) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
pyridoxin (pyrodoxamine) 5'-phosphate oxidase (PPOX); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: YjeF-related protein, N-terminal (InterPro:IPR004443), FMN-binding split barrel (InterPro:IPR012349), Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding domain (InterPro:IPR011576), FMN-binding split barrel, related (InterPro:IPR009002), Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase, rossman domain-containing, predicted, plant (InterPro:IPR021198), Pyridoxine 5'-phosphate oxidase, dimerisation, C-terminal (InterPro:IPR019576), Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase (InterPro:IPR000659), Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase, conserved site (InterPro:IPR019740); Has 8784 Blast hits to 8784 proteins in 2051 species: Archae - 190; Bacteria - 5236; Metazoa - 351; Fungi - 311; Plants - 42; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2654 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:20329213..20332900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59379.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 530 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRNVIRRVTT MTFTFLLQSP PLPISPSPPQ FSLSSSPLSK TQRFITPSQG SRLRTLCTKV IIPNMQDSGS PPLSYLTQRE AAEIDETLMG PLGFSIDQLM 101: ELAGLSVAAS IAEVYKPEEY SRVLAICGPG NNGGDGLVAA RHLHHFGYKP FICYPKRTAK PLYTGLVTQL DSLSVPFVSV EDLPDDLSKD FDVIVDAMFG 201: FSFHGAPRPP FDDLIRRLVS LQNYEQTLQK HPVIVSVDIP SGWHVEEGDH EDGGIKPDML VSLTAPKLCA KRFRGPHHFL GGRFVPPSVA EKYKLELPSY 301: PGTSMCVRIG KPPKVDISAM RVNYVSPELL EEQVETDPTV QFRKWFDEAV AAGLRETNAM ALSTANKDKK PSSRMVLLKG FDENGFVWFT NYESKKGSDL 401: SENPSAALLF YWEILNRQVR IEGPVERIPE SESENYFHSR PRGSQIGAIV SKQSSVVPGR HVLYDEYEEL TKQYSDGSVI PKPKNWGGFR LKPNLFEFWQ 501: GQPSRLHDRL QYSLQDVNGN PAWKIHRLAP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)