AT5G49940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NIFU-like protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein containing the NFU domain and functions as a molecular scaffold for iron-sulfur cluster assembly and delivery. Homologous to the cyanobacterial CNFU protein and is targeted to the chloroplast. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NIFU-like protein 2 (NFU2); FUNCTIONS IN: structural molecule activity; INVOLVED IN: chloroplast organization, iron-sulfur cluster assembly; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NIF system FeS cluster assembly, NifU, C-terminal (InterPro:IPR001075); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NFU domain protein 3 (TAIR:AT4G25910.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:20315464..20317228 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25621.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 235 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQLLTLNPAA ISRTPPQAID PSSSSSLLLP FPQILSSQRA LGLVARPCNP LRRGLSRFLS SRQLFRRSKV VKAVATPDPI LEVPLTEENV ESVLDEIRPY 101: LMSDGGNVAL HEIDGNIVRV KLQGACGSCP SSTMTMKMGI ERRLMEKIPE IVAVEALPDE ETGLELNEEN IEKVLEEIRP YLIGTADGSL DLVEIEDPIV 201: KIRITGPAAG VMTVRVAVTQ KLREKIPSIA AVQLI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)