AT5G47750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : D6 protein kinase like 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
D6 protein kinase like 2 (D6PKL2); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: nucleolus, nucleus, cytoplasm; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: D6 protein kinase like 1 (TAIR:AT4G26610.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:19339947..19341864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64560.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 586 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASTRKPSGH GAEVEAQKRS SSNSSTKSAK AETFEPMQLQ RSVTNPRAVG IPESKRLPES FRKRSSDPAV CKPDFSSLST VLEHVDSLTI DEKKTSGFGS 101: VKTSSASAKL SDGTSSLGKT SGSAKLSGRL DFMESGKSSI CRGSTSSDVS DESSCSSFSS TVNKPHKAND LRWEAIQAVR VRDGLLGLSH FRLLKRLGCG 201: DIGSVYLSEL SGTKCYFAMK VMDKTSLASR KKLLRAQTER EILQSLDHPF LPTLYTHFET EKFSCLVMEF CPGGDLHTLR QRQPGKHFSE QAVKFYIAES 301: LLALEYLHML GIVYRDLKPE NVLVREDGHI MLSDFDLSLR CLVSPTLVKS AAIESDPLRK NVYCVQPACI EPSCIQPSCT VPTTCFSPRL FSSKSKKDRK 401: PKNDTANQVR PLPELVAEPT DARSMSFVGT HEYLAPEIIK GEGHGSAVDW WTFGIFLYEL LFGRTPFKGS GNRQTLFNVV GQPLRFPETP VVSFAARDLI 501: RGLLMKEPQQ RLGFKRGATE VKQHPFFEGV NWALIRCATP PEIPKPVELE KGAVSVAEAP SSQKTAAGLV LNAQKGSDNY LEFDFF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)