AT5G47120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BAX inhibitor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes BI-1, a homolog of mammalian Bax inhibitor 1. Functions as an attenuator of biotic and abiotic types of cell death. Bax-induced cell death can be downregulated by ectopically expressing AtBI in planta. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BAX inhibitor 1 (BI1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inhibitor of apoptosis-promoting Bax1 related (InterPro:IPR006214), Bax inhibitor 1, conserved site (InterPro:IPR006213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Bax inhibitor-1 family protein (TAIR:AT4G17580.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:19136071..19137585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27485.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 247 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDAFSSFFDS QPGSRSWSYD SLKNFRQISP AVQNHLKRVY LTLCCALVAS AFGAYLHVLW NIGGILTTIG CIGTMIWLLS CPPYEHQKRL SLLFVSAVLE 101: GASVGPLIKV AIDVDPSILI TAFVGTAIAF VCFSAAAMLA RRREYLYLGG LLSSGLSMLM WLQFASSIFG GSASIFKFEL YFGLLIFVGY MVVDTQEIIE 201: KAHLGDMDYV KHSLTLFTDF VAVFVRILII MLKNSADKEE KKKKRRN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)