AT5G45550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mob1/phocein family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Mob1/phocein family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mob1/phocein (InterPro:IPR005301); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mob1/phocein family protein (TAIR:AT4G19045.1); Has 1269 Blast hits to 1261 proteins in 207 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 709; Fungi - 290; Plants - 115; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 155 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:18462284..18464840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24697.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 215 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLFGLGRNQ KTFRPKKSAP SGSKGAQLRK HIDATLGSGN LREAVRLPPG EDANEWLAVN TVDFFNQVNL LYGTLTEFCT PDNCPTMTAG PKYEYRWADG 101: VQIKKPIEVS APKYVEYLMD WIETQLDDET LFPQRLGAPF PQNFKDVVKT IFKRLFRVYA HIYHSHFQKI VSLKEEAHLN TCFKHFILFT HEFGLIDKKE 201: LAPLQELIES IISPY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)