AT5G45490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.899 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; FUNCTIONS IN: ATP binding; INVOLVED IN: apoptosis; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NB-ARC (InterPro:IPR002182); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein (TAIR:AT5G45440.1); Has 3977 Blast hits to 3964 proteins in 194 species: Archae - 0; Bacteria - 18; Metazoa - 0; Fungi - 8; Plants - 3946; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:18431064..18432128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40427.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 354 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPSKNLQQAV LTNEFTTNFI TTCKDWLDVN GLAKGNLEKK RDDNEEEERL KTESKLPGHD IHGFDNEIKS LQHFLLDQKV RREFKSLVIV GEYGVGKTAL 101: CQKIFNDEAV KSVYAPRVWV SMENKESKEG LDGKICVLKK ILKGLGVEEL ILETISTDAK QEFKDNEEVA SNQEAGEIDR ETEKEKELSA LLYALHLNLR 201: WKKYLIVFDD VRENDNWDEK LDAKLKEDEK WGKYLSDGFP KGSGGRVIYT TRDENLAKNL VAQKHEIHRL WPLSDHQSVW KIYDAVVKDK QKESPRNDKK 301: CIDELMNKSR GLPLAARLLA ERDPVFVDDE VGPVGSTHGQ TDSSNRQPAN QASS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)