AT5G43780.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase-like family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
sulfate adenylyltransferase, ATP sulfurylase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
APS4; FUNCTIONS IN: sulfate adenylyltransferase (ATP) activity; INVOLVED IN: sulfate assimilation; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase-like (InterPro:IPR015947), Sulphate adenylyltransferase (InterPro:IPR002650); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase-like family protein (TAIR:AT4G14680.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:17589631..17591480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52128.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 469 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSAAAIVS GSPFRSSPLI HNHHASRYAP GSISVVSLPR QVSRRGLSVK SGLIEPDGGK LMNLVVEESR RRVMKHEAET VPARIKLNRV DLEWVHVLSE 101: GWASPLKGFM RQSEFLQTLH FNSFRLEDGS VVNMSVPIVL AIDDDQKFRI GDSNQVTLVD SVGNPIAILN DIEIYKHPKE ERIARTWGTT ARGLPYAEEA 201: ITKAGNWLIG GDLQVLEPIK YNDGLDRFRL SPSQLREEFI RRGADAVFAF QLRNPVHNGH ALLMTDTRRR LLEMGYKNPV LLLNPLGGFT KADDVPLSWR 301: MRQHEKVLED GVLDPETTVV SIFPSPMLYA GPTEVQWHAK ARINAGANFY IVGRDPAGMG HPTEKRDLYD ADHGKKVLSM APGLERLNIL PFKVAAYDKT 401: QGKMAFFDPS RSQDFLFISG TKMRGLAKKK ENPPDGFMCP SGWKVLVDYY DSLSAETGNG RVSEAVASA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)