AT5G37850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pfkB-like carbohydrate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a pyridoxal kinase required for root hair development. Mutants are hypersensitive to Na+, K+ and Li+. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
SALT OVERLY SENSITIVE 4 (SOS4); FUNCTIONS IN: pyridoxal kinase activity, kinase activity; INVOLVED IN: pyridoxine biosynthetic process, hyperosmotic salinity response, trichoblast differentiation, pyridoxal 5'-phosphate salvage; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate (active vitamin B6) biosynthesis, pyridoxal kinase (InterPro:IPR004625), Phosphomethylpyrimidine kinase type-1 (InterPro:IPR013749); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: thiamin biosynthesis protein, putative (TAIR:AT1G22940.1); Has 6182 Blast hits to 6179 proteins in 1931 species: Archae - 81; Bacteria - 5137; Metazoa - 195; Fungi - 190; Plants - 75; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 504 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:15065394..15068783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38168.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 343 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPFSFPTTTT TSLPFHKDHN HFNLNRNLRS RNRRMTTPPV LSLALPSDTG RVLSIQSHTV QGYVGNKSAV FPLQLLGYDV DPINSVQFSN HTGYPTFKGQ 101: VLNGQQLCDL IEGLEANDLL FYTHVLTGYI GSVSFLDTIL EVINKLRSVN PNLTYVCDPV MGDEGKLYVP EELVHVYREK VVPLASMLTP NQFEAEKLTG 201: LRINSEEDGR EACAILHAAG PSKVVITSIT IGGILLLIGS HQKEKGLKPE QFKILIHKIP AYFTGTGDLM TALLLGWSNK YPDNLDKAAE LAVSTLQALL 301: RRTLDDYKRA GYDPTSSSLE IRLIQSQEDI RNPKVELKAE RYS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)