AT5G37180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.787 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sucrose synthase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with sucrose synthase activity (SUS5). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sucrose synthase 5 (SUS5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sucrose synthase, plant/cyanobacteria (InterPro:IPR012820), Sucrose synthase (InterPro:IPR000368), Glycosyl transferase, group 1 (InterPro:IPR001296); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sucrose synthase 6 (TAIR:AT1G73370.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:14718238..14722913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 94910.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 836 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEMTSGSLGN GIPEAMGQNR GNIKRCLEKY IENGRRVMKL NELMDEMEIV INDVTQRRRV MEGDLGKILC FTQAVVIPPN VAFAVRGTPG NWQYVKVNSS 101: NLSVEALSST QYLKLKEFLF DENWANDENA LEVDFGALDF TLPWLSLSSS IGNGLSFVSS KLGGRLNDNP QSLVDYLLSL EHQGEKLMMN ETLNTARKLE 201: MSLILADVFL SELPKDTPFQ AFELRFKECG FEKGWGESAG RVKETMRILS EILQAPDPQN IDRFFARVPR IFNVVIFSVH GYFGQTDVLG LPDTGGQVVY 301: ILDQVKALED ELLQRINSQG LNFKPQILVV TRLIPDAKKT KCNQELEPIF GTKYSNILRI PFVTENGILR RWVSRFDIYP YLERFTKDAT TKILDILEGK 401: PDLIIGNYTD GNLVASLMAN KLGITQATIA HALEKTKYED SDIKWKEFDP KYHFSSQFTA DLISMNSADF IIASTYQEIA GSKERAGQYE SHMSFTVPGL 501: YRVVSGINVF DPRFNIAAPG ADDSIYFPFT AQDRRFTKFY TSIDELLYSQ SENDEHIGYL VDKKKPIIFS MARLDVVKNL TGLTEWYAKN KRLRDLVNLV 601: IVGGFFDASK SKDREEISEI KKMHSLIEKY QLKGQFRWIT AQTDRTRNGE LYRSIADTRG AFVQPAHYEA FGLTVIEAMS CGLVTFATNQ GGPAEIIVDG 701: VSGFHIDPSN GEESSDKIAD FFEKSGMDPD YWNMFSNEGL QRINECYTWK IYANKVINMG STYSYWRHLN KDQKLAKQRY IHSFYNLQYR NLVKTIPILS 801: DIPEPPPLPP KPLVKPSASK GSKRTQPRLS FRLFGA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)