AT5G36220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.824 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome p450 81d1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of CYP81D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome p450 81d1 (CYP81D1); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 81, subfamily D, polypeptide 8 (TAIR:AT4G37370.1); Has 36122 Blast hits to 35977 proteins in 1848 species: Archae - 63; Bacteria - 6210; Metazoa - 11473; Fungi - 7363; Plants - 9418; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1592 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:14253827..14256015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56727.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 502 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEETNIRVVL YSIFSLIFLI ISFKFLKPKK QNLPPSPPGW LPIIGHLRLL KPPIHRTLRS FSETLDHNDG GGVMSLRLGS RLVYVVSSHK VAAEECFGKN 101: DVVLANRPQV IIGKHVGYNN TNMIAAPYGD HWRNLRRLCT IEIFSTHRLN CFLYVRTDEV RRLISRLSRL AGTKKTVVEL KPMLMDLTFN NIMRMMTGKR 201: YYGEETTDEE EAKRVRKLVA DVGANTSSGN AVDYVPILRL FSSYENRVKK LGEETDKFLQ GLIDDKRGQQ ETGTTMIDHL LVLQKSDIEY YTDQIIKGII 301: LIMVIAGTNT SAVTLEWALS NLLNHPDVIS KARDEIDNRV GLDRLIEEAD LSELPYLKNI VLETLRLHPA TPLLVPHMAS EDCKIGSYDM PRGTTLLVNA 401: WAIHRDPNTW DDPDSFKPER FEKEEEAQKL LAFGLGRRAC PGSGLAQRIV GLALGSLIQC FEWERVGNVE VDMKEGVGNT VPKAIPLKAI CKARPFLHKI 501: IS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)