AT5G28640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : SSXT family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with similarity to mammalian transcriptional coactivator that is involved in cell proliferation during leaf and flower development. Loss of function mutations have narrow, pointed leaves and narrow floral organs. AN3 interacts with members of the growth regulating factor (GRF) family of transcription factors. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ANGUSTIFOLIA 3 (AN3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SSXT (InterPro:IPR007726); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GRF1-interacting factor 3 (TAIR:AT4G00850.1); Has 1752 Blast hits to 1579 proteins in 197 species: Archae - 0; Bacteria - 58; Metazoa - 1009; Fungi - 145; Plants - 200; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:10647831..10649620 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22465.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 210 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQQHLMQMQP MMAGYYPSNV TSDHIQQYLD ENKSLILKIV ESQNSGKLSE CAENQARLQR NLMYLAAIAD SQPQPPSVHS QYGSAGGGMI QGEGGSHYLQ 101: QQQATQQQQM TQQSLMAARS SMLYAQQQQQ QQPYATLQHQ QLHHSQLGMS SSSGGGGSSG LHILQGEAGG FHDFGRGKPE MGSGGGGEGR GGSSGDGGET 201: LYLKSSDDGN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)