AT5G27520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 ASURE: peroxisome What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (peroxisomal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : peroxisomal adenine nucleotide carrier 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a peroxisomal adenine nucleotide transporter, involved in fatty acid beta-oxidation during early stage of postgerminative growth. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
peroxisomal adenine nucleotide carrier 2 (PNC2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: peroxisomal adenine nucleotide carrier 1 (TAIR:AT3G05290.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:9714664..9716244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35161.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 321 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGVDLDLESI SEATSGAIGS LLSTTILYPL DTCKSKFQAE IRVRGQQKYR YLSDVFWEAI SSGNVLSLYQ GLGTKNLQSF ISSFIYFYSY SYFKRLHSQR 101: IGSKSIGTKA NLLIAAAAGA CTSVLTQPLD TASSRMQTSE FGKSKGLWKT LTDGSWGNAF DGLGISLLLT SNPAIQYTVF DQLKQNLLEK GKAKSNKDSS 201: PVVLSAFMAF VLGAVSKSAA TVITYPAIRC KVMIQAADDS KENEAKKPRK RIRKTIPGVV YAIWKKEGIL GFFKGLQAQI LKTVLSSALL LMIKEKITAT 301: TWILILAIRT LFVTKARLKS P |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)