AT5G27380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 plastid 0.500 ASURE: cytosol,plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione synthetase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with similarity to glutathione synthetases, which catalyzes one of the early steps in glutathione biosynthesis. Two transcripts have been detected; the longer transcript is less abundant and the protein is localized to the chloroplast. The smaller transcript, in which the transit peptide is truncated, is localized to the cytosol. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione synthetase 2 (GSH2); FUNCTIONS IN: glutathione synthase activity; INVOLVED IN: response to jasmonic acid stimulus, N-terminal protein myristoylation, glutathione biosynthetic process; LOCATED IN: cytosol, chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: PreATP-grasp-like fold (InterPro:IPR016185), ATP-grasp fold, subdomain 2 (InterPro:IPR013816), Glutathione synthase, eukaryotic (InterPro:IPR005615), Glutathione synthase, substrate-binding, eukaryotic (InterPro:IPR004887), Glutathione synthase, alpha-helical, eukaryotic (InterPro:IPR014042); Has 644 Blast hits to 607 proteins in 239 species: Archae - 0; Bacteria - 51; Metazoa - 212; Fungi - 156; Plants - 112; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 113 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:9668211..9670912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60274.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 539 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSGCSSLSY SSSSTCNATV FSISSSPSSS SSLKLNPSSF LFQNPKTLRN QSPLRCGRSF KMESQKPIFD LEKLDDEFVQ KLVYDALVWS SLHGLVVGDK 101: SYQKSGNVPG VGLMHAPIAL LPTAFPEAYW KQACNVTPLF NELIDRVSLD GKFLQDSLSR TKKVDVFTSR LLDIHSKMLE RNKKEDIRLG LHRFDYMLDE 201: ETNSLLQIEM NTISCSFPGL SRLVSQLHQS LLRSYGDQIG IDSERVPINT STIQFADALA KAWLEYSNPR AVVMVIVQPE ERNMYDQHLL SSILREKHNI 301: VVIRKTLAEV EKEGSVQEDE TLIVGGQAVA VVYFRSGYTP NDHPSESEWN ARLLIEESSA VKCPSIAYHL TGSKKIQQEL AKPGVLERFL DNKEDIAKLR 401: KCFAGLWSLD DSEIVKQAIE KPGLFVMKPQ REGGGNNIYG DDVRENLLRL QKEGEEGNAA YILMQRIFPK VSNMFLVREG VYHKHQAISE LGVYGAYLRS 501: KDEVIVNEQS GYLMRTKIAS SDEGGVAAGF GVLDSIYLI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)