AT5G26660.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : myb domain protein 86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
a MYB gene encodes a transcriptional repressor of the C4H gene which is involved in the biosynthesis of sinapate esters. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
myb domain protein 86 (MYB86); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SANT, DNA-binding (InterPro:IPR001005), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), Myb, DNA-binding (InterPro:IPR014778), HTH transcriptional regulator, Myb-type, DNA-binding (InterPro:IPR017930), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287), Myb transcription factor (InterPro:IPR015495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: myb domain protein 50 (TAIR:AT1G57560.1); Has 9095 Blast hits to 8321 proteins in 479 species: Archae - 0; Bacteria - 3; Metazoa - 831; Fungi - 514; Plants - 5926; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 1815 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:9331775..9333044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39792.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 352 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRHSCCFKQ KLRKGLWSPE EDEKLLNYIT RHGHGCWSSV PKLAGLQRCG KSCRLRWINY LRPDLKRGAF SQDEESLIIE LHAALGNRWS QIATRLPGRT 101: DNEIKNFWNS CLKKKLRRKG IDPTTHKPLI TNELQSLNVI DQKLTSSEVV KSTGSINNLH DQSMVVSSQQ GPWWFPANTT TTNQNSAFCF SSSNTTTVSD 201: QIVSLISSMS TSSSPTPMTS NFSPAPNNWE QLNYCNTVPS QSNSIYSAFF GNQYTEASQT MNNNNPLVDQ HHHHQDMKSW ASEILHYTEH NQSSETVIEA 301: EVKPDIANYY WRSASSSSSP NQEAATLLHD ANVEVYGKNL QKLNNMVFDQ SL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)