AT5G20990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : molybdopterin biosynthesis CNX1 protein / molybdenum cofactor biosynthesis enzyme CNX1 (CNX1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Involved in molybdenum cofactor (Moco) biosynthesis, inserting Mo into Molybdopterin. sir loss-of-function mutants are resistant to sirtinol, a modulator of auxin signaling. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
B73; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molybdenum cofactor biosynthesis, conserved site (InterPro:IPR008284), Molybdenum cofactor synthesis (InterPro:IPR020817), MoeA, N-terminal and linker domain (InterPro:IPR005110), MoeA, C-terminal, domain IV (InterPro:IPR005111), Molybdopterin binding (InterPro:IPR001453); Has 13106 Blast hits to 12710 proteins in 1951 species: Archae - 648; Bacteria - 8919; Metazoa - 385; Fungi - 192; Plants - 74; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2888 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:7128737..7133397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71283.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 670 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGQGCCGGG GGKTEMIPTE EALRIVFGVS KRLPPVIVSL YEALGKVLAE DIRAPDPLPP YPASVKDGYA VVASDGPGEY PVITESRAGN DGLGVTVTPG 101: TVAYVTTGGP IPDGADAVVQ VEDTKVIGDV STESKRVKIL IQTKKGTDIR RVGCDIEKDA TVLTTGERIG ASEIGLLATA GVTMVKVYPM PIVAILSTGD 201: ELVEPTAGTL GRGQIRDSNR AMLVAAVMQQ QCKVVDLGIV RDDRKELEKV LDEAVSSGVD IILTSGGVSM GDRDFVKPLL EEKGKVYFSK VLMKPGKPLT 301: FAEIRAKPTE SMLGKTVLAF GLPGNPVSCL VCFNIFVVPT IRQLAGWTSP HPLRVRLRLQ EPIKSDPIRP EFHRAIIKWK DNDGSGTPGF VAESTGHQMS 401: SRLLSMRSAN ALLELPATGN VLSAGSSVSA IIVSDISAFS IDKKASLSEP GSIRKEKKYD EVPGPEYKVA ILTVSDTVSA GAGPDRSGPR AVSVVDSSSE 501: KLGGAKVVAT AVVPDEVERI KDILQKWSDV DEMDLILTLG GTGFTPRDVT PEATKKVIER ETPGLLFVMM QESLKITPFA MLSRSAAGIR GSTLIINMPG 601: NPNAVAECME ALLPALKHAL KQIKGDKREK HPKHIPHAEA TLPTDTWDQS YKSAYETGEK KEEAGCSCTH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)