AT5G20960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.992 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aldehyde oxidase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes aldehyde oxidase AA01. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aldehyde oxidase 1 (AO1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase (InterPro:IPR016208), Ferredoxin (InterPro:IPR001041), Molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding (InterPro:IPR002346), Beta-grasp fold, ferredoxin-type (InterPro:IPR012675), [2Fe-2S]-binding (InterPro:IPR002888), FAD-binding, type 2 (InterPro:IPR016166), CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal (InterPro:IPR005107), 2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site (InterPro:IPR006058), CO dehydrogenase flavoprotein-like, FAD-binding, subdomain 2 (InterPro:IPR016169), Aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase, a/b hammerhead (InterPro:IPR000674), Aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding (InterPro:IPR008274); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aldehyde oxidase 2 (TAIR:AT3G43600.1); Has 18277 Blast hits to 17619 proteins in 1295 species: Archae - 420; Bacteria - 10771; Metazoa - 1021; Fungi - 121; Plants - 280; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5664 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:7116783..7122338 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 149563.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1368 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MGEKAIDEDK VEAMKSSKTS LVFAINGQRF ELELSSIDPS TTLVDFLRNK TPFKSVKLGC GEGGCGACVV LLSKYDPLLE KVDEFTISSC LTLLCSIDGC 0101: SITTSDGLGN SRVGFHAVHE RIAGFHATQC GFCTPGMSVS MFSALLNADK SHPPPRSGFS NLTAVEAEKA VSGNLCRCTG YRPLVDACKS FAADVDIEDL 0201: GFNAFCKKGE NRDEVLRRLP CYDHTSSHVC TFPEFLKKEI KNDMSLHSRK YRWSSPVSVS ELQGLLEVEN GLSVKLVAGN TSTGYYKEEK ERKYERFIDI 0301: RKIPEFTMVR SDEKGVELGA CVTISKAIEV LREEKNVSVL AKIATHMEKI ANRFVRNTGT IGGNIMMAQR KQFPSDLATI LVAAQATVKI MTSSSSQEQF 0401: TLEEFLQQPP LDAKSLLLSL EIPSWHSAKK NGSSEDSILL FETYRAAPRP LGNALAFLNA AFSAEVTEAL DGIVVNDCQL VFGAYGTKHA HRAKKVEEFL 0501: TGKVISDEVL MEAISLLKDE IVPDKGTSNP GYRSSLAVTF LFEFFGSLTK KNAKTTNGWL NGGCKEIGFD QNVESLKPEA MLSSAQQIVE NQEHSPVGKG 0601: ITKAGACLQA SGEAVYVDDI PAPENCLYGA FIYSTMPLAR IKGIRFKQNR VPEGVLGIIT YKDIPKGGQN IGTNGFFTSD LLFAEEVTHC AGQIIAFLVA 0701: DSQKHADIAA NLVVIDYDTK DLKPPILSLE EAVENFSLFE VPPPLRGYPV GDITKGMDEA EHKILGSKIS FGSQYFFYME TQTALAVPDE DNCMVVYSST 0801: QTPEFVHQTI AGCLGVPENN VRVITRRVGG GFGGKAVKSM PVAAACALAA SKMQRPVRTY VNRKTDMITT GGRHPMKVTY SVGFKSNGKI TALDVEVLLD 0901: AGLTEDISPL MPKGIQGALM KYDWGALSFN VKVCKTNTVS RTALRAPGDV QGSYIGEAII EKVASYLSVD VDEIRKVNLH TYESLRLFHS AKAGEFSEYT 1001: LPLLWDRIDE FSGFNKRRKV VEEFNASNKW RKRGISRVPA VYAVNMRSTP GRVSVLGDGS IVVEVQGIEI GQGLWTKVKQ MAAYSLGLIQ CGTTSDELLK 1101: KIRVIQSDTL SMVQGSMTAG STTSEASSEA VRICCDGLVE RLLPVKTALV EQTGGPVTWD SLISQAYQQS INMSVSSKYM PDSTGEYLNY GIAASEVEVN 1201: VLTGETTILR TDIIYDCGKS LNPAVDLGQI EGAFVQGLGF FMLEEFLMNS DGLVVTDSTW TYKIPTVDTI PRQFNVEILN SGQHKNRVLS SKASGEPPLL 1301: LAASVHCAVR AAVKEARKQI LSWNSNKQGT DMYFELPVPA TMPIVKEFCG LDVVEKYLEW KIQQRKNV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)