AT5G19830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Peptidyl-tRNA hydrolase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Peptidyl-tRNA hydrolase family protein; FUNCTIONS IN: aminoacyl-tRNA hydrolase activity; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 16 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidyl-tRNA hydrolase, conserved site (InterPro:IPR018171), Peptidyl-tRNA hydrolase (InterPro:IPR001328); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peptidyl-tRNA hydrolase family protein (TAIR:AT5G16140.2); Has 7915 Blast hits to 7912 proteins in 2585 species: Archae - 0; Bacteria - 5291; Metazoa - 47; Fungi - 78; Plants - 126; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2373 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:6703383..6705125 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24600.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 219 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLSRLSRRCY CTSSVHRPWL FLGLGNPGDK YKGTRHNIGF EMIDVFAESV GIQMNLVNFK AIMGQGFVAD LPVILAKPQT YMNLSGESSG PLAAYYKLPL 101: NRVLVVHDDM QLPCGVLRLQ EKGGHGCHNG LKSVMNHFRG NREFARLRIG IGKPPGQMDP KAFLLQKFSM PARERMDKAL AEGVDALKLV LAKDFGESWR 201: LFNVEQKYKH LKQHTILSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)