AT5G18070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.500 plastid 0.500 ASURE: mitochondrion,plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphoglucosamine mutase-related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a novel protein involved in DNA repair from UV damage. Isolated by functional complementation of E. coli UV-sensitive mutants (UVR genes). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DNA-DAMAGE-REPAIR/TOLERATION 101 (DRT101); FUNCTIONS IN: intramolecular transferase activity, phosphotransferases, phosphoacetylglucosamine mutase activity; INVOLVED IN: response to UV, photoreactive repair; LOCATED IN: cytosol, mitochondrion; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alpha-D-phosphohexomutase, C-terminal (InterPro:IPR005843), Alpha-D-phosphohexomutase, alpha/beta/alpha domain III (InterPro:IPR005846), Phosphoacetylglucosamine mutase (InterPro:IPR016657), Alpha-D-phosphohexomutase, alpha/beta/alpha domain II (InterPro:IPR005845), Alpha-D-phosphohexomutase, alpha/beta/alpha I/II/III (InterPro:IPR016055), Alpha-D-phosphohexomutase, alpha/beta/alpha domain I (InterPro:IPR005844); Has 6617 Blast hits to 6213 proteins in 2284 species: Archae - 117; Bacteria - 4667; Metazoa - 169; Fungi - 157; Plants - 47; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1460 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:5981117..5982787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60393.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 556 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDEIQIASIL KSSELFPIPQ GVKLSYGTAG FRGDAKLLES TVYRVGILSA LRSLKLGSAT VGLMITASHN KVSDNGIKVS DPSGFMLSQE WEPFADQIAN 101: ASSPEELVSL IRKFMEKEEI AIGENNKGAE VWLGRDTRPS GESLLRAGEI GVGSILGSVA IDIGILTTPQ LHWMVRAKNK GLKATENDYF ENLSTSFRCL 201: IDLIPSSGND KLEISKLLVD GANGVGGQKI EKLRGSLSNL DVEIRNTGRD GGVLNEGVGA DFVQKEKVLP VGFGFKDVGM RCASLDGDAD RLVYFYIPSD 301: SSEKVELLDG DKILSLFALF IKEQLNALED DEERKQSRLG VVQTAYANGA STDYLKHLGL DVVFAKTGVK HLHEKAAEFD IGIYFEANGH GTILFSESFL 401: SWLVSKQKDL TAKGQGGSEE HKAVSRLMAV SNLINQAVGD ALSGVLLVEV ILQHLGWSIE KWNELYKDLP SRQIKVEVPD RTAVVTTSEE TEALRPMGIQ 501: DAINSEIKKY SRGRAFIRPS GTEDVVRVYA EASTQEDADS LANSVAQLVK SFLGSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)