AT5G17690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : like heterochromatin protein (LHP1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Regulates the meristem response to light signals and the maintenance of inflorescence meristem identity. Influences developmental processes controlled by APETALA1. TFL2 silences specific genes within euchromatin but not genes positioned in heterochromatin. TFL2 protein localized preferentially to euchromatic regions and not to heterochromatic chromocenters. Involved in euchromatin organization. Required for epigenetic maintenance of the vernalized state. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
TERMINAL FLOWER 2 (TFL2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Chromo domain subgroup (InterPro:IPR017984), Chromo domain-like (InterPro:IPR016197), Chromo shadow, subgroup (InterPro:IPR018125), Chromo domain (InterPro:IPR000953); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:5827504..5829537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48647.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 445 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKGASGAVKK KPQVLNEAGE AETAVETVGE SRKISGDGGF GSDDGGGGGG GGSGESILRE IGDDRPTEDG DEEEEEDEDE DDGGDEEDEE GEGEGGQEER 101: PKLDEGFYEI EAIRRKRVRK GKVQYLIKWR GWPETANTWE PLENLQSIAD VIDAFEGSLK PGKPGRKRKR KYAGPHSQMK KKQRLTSTSH DATEKSDSST 201: SLNNSSLPDI PDPLDLSGSS LLNRDVEAKN AYVSNQVEAN SGSVGMARQV RLIDNEKEYD PTLNELRGPV NNSNGAGCSQ GGGIGSEGDN VRPNGLLKVY 301: PKELDKNSRF IGAKRRKSGS VKRFKQDGST SNNHTAPTDQ NLTPDLTTLD SFGRIARMGN EYPGVMENCN LSQKTKIEEL DITKILKPMS FTASVSDNVQ 401: EVLVTFLALR SDGKEALVDN RFLKAHNPHL LIEFYEQHLK YNRTP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)