AT5G16710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dehydroascorbate reductase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
The protein undergoes thiolation following treatment with the oxidant tert-butylhydroperoxide. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
dehydroascorbate reductase 1 (DHAR3); FUNCTIONS IN: glutathione dehydrogenase (ascorbate) activity; INVOLVED IN: protein amino acid glutathionylation; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Glutathione S-transferase, N-terminal (InterPro:IPR004045), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: dehydroascorbate reductase 2 (TAIR:AT1G75270.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:5483312..5484926 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28515.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 258 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MISLRFQPST TAGVLSASVS RAGFIKRCGS TKPGRVGRFV TMATAASPLE ICVKASITTP NKLGDCPFCQ KVLLTMEEKN VPYDMKMVDL SNKPEWFLKI 101: SPEGKVPVVK FDEKWVPDSD VITQALEEKY PEPPLATPPE KASVGSKIFS TFVGFLKSKD SGDGTEQVLL DELTTFNDYI KDNGPFINGE KISAADLSLA 201: PKLYHMKIAL GHYKNWSVPD SLPFVKSYME NVFSRESFTN TRAETEDVIA GWRPKVMG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)