AT5G16150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : plastidic GLC translocator | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative plastidic glucose transporter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
plastidic GLC translocator (PGLCT); FUNCTIONS IN: carbohydrate transmembrane transporter activity, sugar:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: response to trehalose stimulus; LOCATED IN: membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Major facilitator superfamily protein (TAIR:AT1G05030.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:5272904..5275678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56973.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 546 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQSSTYAVKG NAAFAFQRRT FSSDRSTTST GIRFAGYKSL ATTGPLYCSG SEAMGATLAR ADNGIQSVMS FSSVKARSVR AQASSDGDEE EAIPLRSEGK 101: SSGTVLPFVG VACLGAILFG YHLGVVNGAL EYLAKDLGIA ENTVLQGWIV SSLLAGATVG SFTGGALADK FGRTRTFQLD AIPLAIGAFL CATAQSVQTM 201: IVGRLLAGIG IGISSAIVPL YISEISPTEI RGALGSVNQL FICIGILAAL IAGLPLAANP LWWRTMFGVA VIPSVLLAIG MAFSPESPRW LVQQGKVSEA 301: EKAIKTLYGK ERVVELVRDL SASGQGSSEP EAGWFDLFSS RYWKVVSVGA ALFLFQQLAG INAVVYYSTS VFRSAGIQSD VAASALVGAS NVFGTAVASS 401: LMDKMGRKSL LLTSFGGMAL SMLLLSLSFT WKALAAYSGT LAVVGTVLYV LSFSLGAGPV PALLLPEIFA SRIRAKAVAL SLGMHWISNF VIGLYFLSVV 501: TKFGISSVYL GFAGVCVLAV LYIAGNVVET KGRSLEEIEL ALTSGA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)