AT5G15770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glucose-6-phosphate acetyltransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative glucose-6-phosphate acetyltransferase involved in UDP-N-acetylglucosamine biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glucose-6-phosphate acetyltransferase 1 (GNA1); FUNCTIONS IN: glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase activity, N-acetyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GCN5-related N-acetyltransferase, C-terminal (InterPro:IPR022610), GCN5-related N-acetyltransferase (InterPro:IPR000182), Acyl-CoA N-acyltransferase (InterPro:IPR016181); Has 806 Blast hits to 799 proteins in 307 species: Archae - 17; Bacteria - 208; Metazoa - 186; Fungi - 170; Plants - 47; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 175 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:5144093..5144542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17028.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 149 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAETFKIRKL EISDKRKGFI ELLGQLTVTG SVTDEEFDRR FEEIRSYGDD HVICVIEEET SGKIAATGSV MIEKKFLRNC GKAGHIEDVV VDSRFRGKQL 101: GKKVVEFLMD HCKSMGCYKV ILDCSVENKV FYEKCGMSNK SIQMSKYFD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)