AT5G14750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : myb domain protein 66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a MyB-related protein containing R2 and R3 repeats, involved in root and hypocotyl epidermal cell fate determination. Loss of function mutations make extra root hairs. Nuclear localized protein is a positive regulator for expression of CAPRICE (CPC). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
myb domain protein 66 (MYB66); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SANT, DNA-binding (InterPro:IPR001005), Myb, DNA-binding (InterPro:IPR014778), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287), Myb transcription factor (InterPro:IPR015495), HTH transcriptional regulator, Myb-type, DNA-binding (InterPro:IPR017930); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: myb domain protein 23 (TAIR:AT5G40330.1); Has 9181 Blast hits to 8410 proteins in 556 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 822; Fungi - 534; Plants - 5944; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1878 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:4763656..4764738 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23569.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 203 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRKKVSSSGD EGNNEYKKGL WTVEEDKILM DYVKAHGKGH WNRIAKKTGL KRCGKSCRLR WMNYLSPNVK RGNFTEQEED LIIRLHKLLG NRWSLIAKRV 101: PGRTDNQVKN YWNTHLSKKL GIKDQKTKQS NGDIVYQINL PNPTETSEET KISNIVDNNN ILGDEIQEDH QGSNYLSSLW VHEDEFELST LTNMMDFIDG 201: HCF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)