AT5G14470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GHMP kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GHMP kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity, phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor, galactokinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: metabolic process, phosphorylation; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: inflorescence meristem, flower, carpel, pollen tube; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mevalonate/galactokinase (InterPro:IPR006206), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), GHMP kinase (InterPro:IPR006204), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup (InterPro:IPR014721), GHMP kinase, C-terminal (InterPro:IPR013750); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glucuronokinase G (TAIR:AT3G01640.1); Has 369 Blast hits to 369 proteins in 134 species: Archae - 34; Bacteria - 179; Metazoa - 12; Fungi - 0; Plants - 66; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 78 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:4663029..4664657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40863.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 366 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDPNPKPAIS GKDNGVFEHR SFARIGFLGN PSDVYFGRTI SFTIGNFWAW AKLEPSDHLL IKPHPFHDLV QFDSLDNLVY RLENDGYYGG VRLLMAICKV 101: FRNYCKENGI QLHDKNFTLS YDTNIPRQTG LSGSSAIVSA ALSCLLDFYN VRQSIRIEVR PNLILNAEKE LGIVAGLQDR VAQVYGGGLV HMDFSKEHMD 201: KVGYGIYTIM DINLLPPLHL IYAENPSDSG KVHSTVRRRW LDGDEFIISS MAEIAKLAEE GRTALLKKDY SNLKELMNRN FDLRRSMFGD ECLGAMNIEM 301: VEVARKIGAA AKFTGSGGAV VVFCPEGPSQ VKLLEEECRK SGFIVEPVKL VPTRLSSSDI KTLSKT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)