AT5G14430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; LOCATED IN: Golgi apparatus, plasma membrane, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT3G23300.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:4653092..4655741 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69867.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 612 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKHFRTERVR ATPKLFTYVL VGFIALLGLT CLYYGSSFAP GSRKSDEFDG SNNRVRTGIG SLRNRDIVLA VSRFEVPKSV PICDSRHSEL IPCLDRNLHY 101: QLKLKLNLSL MEHYEHHCPP SERRFNCLVP PPVGYKIPLR WPVSRDEVWK ANIPHTHLAQ EKSDQNWMVV NGDKINFPGG GTHFHNGADK YIVSLAQMLK 201: FPGDKLNNGG SIRNVLDVGC GVASFGAYLL SHDIIAMSLA PNDVHQNQIQ FALERGIPST LGVLGTKRLP YPSRSFELAH CSRCRIDWLQ RDGILLLELD 301: RLLRPGGYFV YSSPEAYAHD PENRKIGNAM HDLFKRMCWK VVAKRDQSVI WGKPISNSCY LKRDPGVLPP LCPSGDDPDA TWNVSMKACI SPYSVRMHKE 401: RWSGLVPWPR RLTAPPPRLE EIGVTPEQFR EDTETWRLRV IEYWKLLKPM VQKNSIRNVM DMSSNLGGFA AALNDKDVWV MNVMPVQSSP RMKIIYDRGL 501: IGATHDWCEA FDTYPRTFDL IHAWNTFTET QARGCSFEDL LIEMDRILRP EGFVIIRDTT DNISYIKKYL TLLKWDKWST ETTPKGDPLS TKDEIVLIAR 601: KKLWSLPAIS VS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)