AT5G14300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : prohibitin 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
prohibitin 5 (PHB5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prohibitin (InterPro:IPR000163), Band 7 protein (InterPro:IPR001107); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: prohibitin 4 (TAIR:AT3G27280.1); Has 2683 Blast hits to 2683 proteins in 797 species: Archae - 146; Bacteria - 1077; Metazoa - 455; Fungi - 281; Plants - 201; Viruses - 7; Other Eukaryotes - 516 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:4613102..4614023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27393.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 249 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPWSKFTKVA LGLGAAIAAV RSTMFTVDGG QRAVMFHRFE GILEEPVGEG THRKIPWVQK PYIFDIRTKP YKINTDSGTK DLQMVNLTLR VMFRPDVVKA 101: VVAQFNADEL LTERPQVSAL IRETLIKRAK EFNIVLDDVS ITGLSYGKEF SLAVERKQVA QQEAERSKFV VAKADQERRA AVIRAEGESE AARVISKATA 201: GAGMGLIKLR RVEAAREVAI TLSNSPNVVY LPSGGNMLFA MNGPSKVVA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)