AT5G14070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.995 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Thioredoxin superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes glutaredoxin ROXY2. ROXY2, together with ROXY1 (AT3G02000), controls anther development. roxy1 roxy2 double mutants are sterile and do not produce pollen. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ROXY2; FUNCTIONS IN: electron carrier activity, protein disulfide oxidoreductase activity; INVOLVED IN: negative regulation of transcription, anther development; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: tapetum, floral meristem, hypocotyl, anther, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutaredoxin-like, plant II (InterPro:IPR011905), Glutaredoxin (InterPro:IPR002109), Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Thioredoxin superfamily protein (TAIR:AT3G02000.1); Has 1062 Blast hits to 1060 proteins in 157 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 185; Fungi - 99; Plants - 740; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 34 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:4541915..4542337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14970.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 140 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQYKTETRGS LSYNNNSKVM NNMNVFPSET LAKIESMAAE NAVVIFSVST CCMCHAIKRL FRGMGVSPAV HELDLLPYGV EIHRALLRLL GCSSGGATSP 101: GALPVVFIGG KMVGAMERVM ASHINGSLVP LLKDAGALWL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)