AT5G13550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfate transporter 4.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a sulfate transporter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfate transporter 4.1 (SULTR4;1); FUNCTIONS IN: sulfate transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: sulfate transport, transport, transmembrane transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulphate transporter (InterPro:IPR011547), Sulphate transporter/antisigma-factor antagonist STAS (InterPro:IPR002645), Sulphate anion transporter, conserved site (InterPro:IPR018045), Sulphate anion transporter (InterPro:IPR001902); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfate transporter 4;2 (TAIR:AT3G12520.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:4355412..4359490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 75099.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 685 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSYASLSVKD LTSLVSRSGT GSSSSLKPPG QTRPVKVIPL QHPDTSNEAR PPSIPFDDIF SGWTAKIKRM RLVDWIDTLF PCFRWIRTYR WSEYFKLDLM 101: AGITVGIMLV PQAMSYAKLA GLPPIYGLYS SFVPVFVYAI FGSSRQLAIG PVALVSLLVS NALGGIADTN EELHIELAIL LALLVGILEC IMGLLRLGWL 201: IRFISHSVIS GFTSASAIVI GLSQIKYFLG YSIARSSKIV PIVESIIAGA DKFQWPPFVM GSLILVILQV MKHVGKAKKE LQFLRAAAPL TGIVLGTTIA 301: KVFHPPSISL VGEIPQGLPT FSFPRSFDHA KTLLPTSALI TGVAILESVG IAKALAAKNR YELDSNSELF GLGVANILGS LFSAYPATGS FSRSAVNNES 401: EAKTGLSGLI TGIIIGCSLL FLTPMFKYIP QCALAAIVIS AVSGLVDYDE AIFLWRVDKR DFSLWTITST ITLFFGIEIG VLVGVGFSLA FVIHESANPH 501: IAVLGRLPGT TVYRNIKQYP EAYTYNGIVI VRIDSPIYFA NISYIKDRLR EYEVAVDKYT NRGLEVDRIN FVILEMSPVT HIDSSAVEAL KELYQEYKTR 601: DIQLAISNPN KDVHLTIARS GMVELVGKEW FFVRVHDAVQ VCLQYVQSSN LEDKHLSFTR RYGGSNNNSS SSNALLKEPL LSVEK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)