AT5G13060.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ARMADILLO BTB protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a novel Armadillo BTB protein that intreacts with the pre-replication complex and several transcription factors. Overexpression results in decreased cell proliferation and loss of function results in increased cell proliferation suggesting a role in negative regulation of cellular proliferation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ARMADILLO BTB protein 1 (ABAP1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: HEAT (InterPro:IPR000357), Armadillo-like helical (InterPro:IPR011989), BTB/POZ fold (InterPro:IPR011333), Armadillo (InterPro:IPR000225), BTB/POZ (InterPro:IPR013069), Armadillo-type fold (InterPro:IPR016024), BTB/POZ-like (InterPro:IPR000210); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ARM repeat protein interacting with ABF2 (TAIR:AT5G19330.1); Has 15271 Blast hits to 11668 proteins in 362 species: Archae - 10; Bacteria - 68; Metazoa - 9499; Fungi - 805; Plants - 3646; Viruses - 85; Other Eukaryotes - 1158 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:4142958..4146952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 81365.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 737 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIISKSFKAP LKFSVKSSTA PVISNHPPME NHPKRQRTTR LAARNLKRKL SHNTDGAPIV TQLIDIDDEP IDLVVAIRRH VEVLNSSFSD PDFDHEAVKE 101: AAADIADLAK IDENVEIIVE NGAIPALVRY LESPLVVCGN VPKSCEHKLE KDCALALGLI AAIQPGYQQL IVDAGAIVPT VKLLKRRGEC GECMFANAVI 201: RRAADIITNI AHDNPRIKTN IRVEGGIAPL VELLNFPDVK VQRAAAGALR TVSFRNDENK SQIVELNALP TLVLMLQSQD STVHGEAIGA IGNLVHSSPD 301: IKKEVIRAGA LQPVIGLLSS TCLETQREAA LLIGQFAAPD SDCKVHIAQR GAITPLIKML ESSDEQVVEM SAFALGRLAQ DAHNQAGIAH RGGIISLLNL 401: LDVKTGSVQH NAAFALYGLA DNEENVADFI KAGGIQKLQD DNFTVQPTRD CVVRTLKRLQ NKIHGPVLNQ LLYLMRTAEK TVQIRIALAL AHLCDPKDGK 501: LIFIDNNGVE FLLELLYFSS NKQQRYSSSA LYELAKKATS FAPEDSAPCS PTQQVFLGEK FVNNPTMSDV TFLIDGKQFY AHKIGLVASS DIFRAMFDGL 601: YKERNAQNVE IPNIRWEVFE LMMKFIYSGR INIAKHLAKD LLVAADQYLL EGLKRQCEYT IAQEICLDNI PEMYELADTF NASALRRACT LFVLEHFTKL 701: SSQLWFAKFV KQIIPEIRSY MTDILTRPVE ASPPTVV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)