AT5G11160.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.724 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : adenine phosphoribosyltransferase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
adenine phosphoribosyltransferase 5 (APT5); FUNCTIONS IN: adenine phosphoribosyltransferase activity; INVOLVED IN: nucleoside metabolic process, adenine salvage, anaerobic respiration, nucleotide metabolic process; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenine phosphoribosyl transferase (InterPro:IPR005764), Phosphoribosyltransferase (InterPro:IPR000836); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: adenine phosphoribosyl transferase 2 (TAIR:AT1G80050.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:3550774..3551986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20758.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 191 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFAAENGLKG DPRLEAISAA IRVVPNFPKK GIMFQDITTL LLDHKAFKHT IDIFVDRYKD MQISVVAGVE ARGFLFGPSI ALAIGAKFIP LRKPGKLPGK 101: VISESYELEY GHDRLEMHVG AVEPRERVII IDDLVATGGT LSAAMSLLES QGAEVVECAC VIGLPEVKGQ HKLKGKPLYV LVEPSGLDEF C |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)