AT5G10930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.929 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CBL-interacting protein kinase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes CBL-interacting protein kinase 5 (CIPK5). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CBL-interacting protein kinase 5 (CIPK5); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: signal transduction, protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), NAF/FISL domain (InterPro:IPR018451), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), NAF domain (InterPro:IPR004041), CBL-interacting protein kinase (InterPro:IPR020660), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CBL-interacting protein kinase 25 (TAIR:AT5G25110.1); Has 132030 Blast hits to 129710 proteins in 4599 species: Archae - 195; Bacteria - 15419; Metazoa - 48583; Fungi - 13177; Plants - 32322; Viruses - 524; Other Eukaryotes - 21810 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3445569..3446906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50877.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 445 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEEERRVLFG KYEMGRLLGK GTFAKVYYGK EIIGGECVAI KVINKDQVMK RPGMMEQIKR EISIMKLVRH PNIVELKEVM ATKTKIFFVM EFVKGGELFC 101: KISKGKLHED AARRYFQQLI SAVDYCHSRG VSHRDLKPEN LLLDENGDLK ISDFGLSALP EQILQDGLLH TQCGTPAYVA PEVLKKKGYD GAKADIWSCG 201: VVLYVLLAGC LPFQDENLMN MYRKIFRADF EFPPWFSPEA RRLISKLLVV DPDRRISIPA IMRTPWLRKN FTPPLAFKID EPICSQSSKN NEEEEEDGDC 301: ENQTEPISPK FFNAFEFISS MSSGFDLSSL FESKRKVQSV FTSRSSATEV MEKIETVTKE MNMKVKRTKD FKVKMEGKTE GRKGRLSMTA EVFEVAPEIS 401: VVEFCKSAGD TLEYDRLYEE EVRPALNDIV WSWHGDNNNT SSEDC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)