AT5G10520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 nucleus 0.500 ASURE: cytosol,nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ROP binding protein kinases 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ROP binding protein kinases 1 (RBK1); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: defense response, incompatible interaction; LOCATED IN: cytosol, endomembrane system; EXPRESSED IN: 6 plant structures; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT5G65530.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3320584..3322649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52654.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 467 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVEDNKNSE SKNHQEVELH RNDLGLEDSS SPRGVLGMVS DSDNSSSSCS SCSSDDKSSS TSSPFSNTTK TVSSSHHGLQ WNKMIESIKK KSMRRFSVIP 101: LLASYELTRK NLRRKQPKLT PSESAFTCEA FFMAKPSWRN FTYEELAVAT DYFNPENMIG KGGHAEVYKG VLINGETVAI KKLMSHAKEE EERVSDFLSE 201: LGIIAHVNHP NAARLRGFSS DRGLHFVLEY APYGSLASML FGSEECLEWK IRYKVALGIA DGLSYLHNAC PRRIIHRDIK ASNILLNHDY EAQISDFGLA 301: KWLPENWPHH VVFPIEGTFG YLAPEYFMHG IVDEKIDVFA FGVLLLEIIT SRRAVDTASR QSIVAWAKPF LEKNSMEDIV DPRLGNMFNP TEMQRVMLTA 401: SMCVHHIAAM RPDMTRLVQL LRGEDGPAEL QQKAGERTMS VNACDLQDHT SSSYLNELRR HRQLLME |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)