AT5G09930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ABC transporter family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of GCN subfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GENERAL CONTROL NON-REPRESSIBLE 2 (GCN2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ABC transporter-like (InterPro:IPR003439), ABC transporter, conserved site (InterPro:IPR017871); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: general control non-repressible 5 (TAIR:AT5G64840.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3097643..3100241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 76495.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 678 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVLTTNLYSL NLRSTFFFTN TITCPTLFTF KLSSVSNPRR VFPNIRAHVS AASSNSELES LLSTDRKLIS KQSNNGASSI SSGVRLENIS KSYEGITVLK 101: DVTWEVKKGE KVGLIGVNGA GKTTQLRIIT GQEEPDSGNV IWAKPNLKVA FLSQEFEVSM GKTVKEEFMC TFKEEMEIAR KLENLQKAIE EAVDDLELMG 201: KLLDEFDLLQ RRAQEVDLDS IHAKISKLMS ELGFVSEDAD RLVASFSSGW QMRMSLGKIL LQNPDLLLLD EPTNHLDLDT IEWLEGYLIK QDVPMVIISH 301: DRAFLDQLCT KIVETEMGVS RTFDGNYSQY VISKAELVEA QYAAWEKQQK EIEATKDLIS RLSAGANSGR ASSAEKKLEK LQEEELIEKP FQRKQMKIRF 401: PECGLSGRSV VTVKNLVFGF DDKMLFNKAN LAIERGEKVA IIGPNGCGKS TLLKLIMGLE KPMRGEVILG EHNVLPNYFE QNQAEAQDLD KTVIETVVEA 501: AVDWRIDDIK ALLGRCNFKA DMLDRKVSLL SGGEKARLAF CKFMVKPSTL LVLDEPTNHL DIPSKEMLEE AINEYKGTVI TVSHDRYFIK QIVNRVIEVR 601: DGGLMDYAGD YNYFLEKNVE ARARELEREA ELEEKAPKVK AKSKMSKAER EARKKQKMKA FQASKKKSKS SKNAKRWN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)