AT5G07390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : respiratory burst oxidase homolog A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
respiratory burst oxidase homolog A (RBOHA); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ferredoxin reductase-type FAD-binding domain (InterPro:IPR017927), Cytochrome b245, heavy chain (InterPro:IPR000778), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), Ferric reductase-like transmembrane component, N-terminal (InterPro:IPR013130), NADPH oxidase Respiratory burst (InterPro:IPR013623), Ferric reductase, NAD binding (InterPro:IPR013121), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), FAD-binding 8 (InterPro:IPR013112), Riboflavin synthase-like beta-barrel (InterPro:IPR017938); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NADPH/respiratory burst oxidase protein D (TAIR:AT5G51060.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:2336063..2339728 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 102941.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 902 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMNRSEMQKL GFEHVRYYTE SPYNRGESSA NVATTSNYYG EDEPYVEITL DIHDDSVSVY GLKSPNHRGA GSNYEDQSLL RQGRSGRSNS VLKRLASSVS 101: TGITRVASSV SSSSARKPPR PQLAKLRRSK SRAELALKGL KFITKTDGVT GWPEVEKRFY VMTMTTNGLL HRSRFGECIG MKSTEFALAL FDALARRENV 201: SGDSININEL KEFWKQITDQ DFDSRLRTFF AMVDKDSDGR LNEAEVREII TLSASANELD NIRRQADEYA ALIMEELDPY HYGYIMIENL EILLLQAPMQ 301: DVRDGEGKKL SKMLSQNLMV PQSRNLGARF CRGMKYFLFD NWKRVWVMAL WIGAMAGLFT WKFMEYRKRS AYEVMGVCVC IAKGAAETLK LNMAMILLPV 401: CRNTITWLRT KTKLSAIVPF DDSLNFHKVI AIGISVGVGI HATSHLACDF PRLIAADEDQ YEPMEKYFGP QTKRYLDFVQ SVEGVTGIGM VVLMTIAFTL 501: ATTWFRRNKL NLPGPLKKIT GFNAFWYSHH LFVIVYSLLV VHGFYVYLII EPWYKKTTWM YLMVPVVLYL CERLIRAFRS SVEAVSVLKV AVLPGNVLSL 601: HLSRPSNFRY KSGQYMYLNC SAVSTLEWHP FSITSAPGDD YLSVHIRVLG DWTKQLRSLF SEVCKPRPPD EHRLNRADSK HWDYIPDFPR ILIDGPYGAP 701: AQDYKKFEVV LLVGLGIGAT PMISIVSDII NNLKGVEEGS NRRQSPIHNM VTPPVSPSRK SETFRTKRAY FYWVTREQGS FDWFKNVMDE VTETDRKNVI 801: ELHNYCTSVY EEGDARSALI TMLQSLNHAK HGVDVVSGTR VMSHFARPNW RSVFKRIAVN HPKTRVGVFY CGAAGLVKEL RHLSLDFSHK TSTKFIFHKE 901: NF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)