AT5G04180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha carbonic anhydrase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
alpha carbonic anhydrase 3 (ACA3); FUNCTIONS IN: carbonate dehydratase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: response to carbon dioxide, one-carbon metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 11 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis, C globular stage, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbonic anhydrase, alpha-class, catalytic domain (InterPro:IPR001148), Carbonic anhydrase, CAH1-like (InterPro:IPR018340); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha carbonic anhydrase 4 (TAIR:AT4G20990.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:1147907..1149237 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31399.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 277 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKTIILFVTF LALSSSSLAD ETETEFHYKP GEIADPSKWS SIKAEWKICG TGKRQSPINL TPKIARIVHN STEILQTYYK PVEAILKNRG FDMKVKWEDD 101: AGKIVINDTD YKLVQSHWHA PSEHFLDGQR LAMELHMVHK SVEGHLAVIG VLFREGEPNA FISRIMDKIH KIADVQDGEV SIGKIDPREF GWDLTKFYEY 201: RGSLTTPPCT EDVMWTIINK VGTVSREQID VLTDARRGGY EKNARPAQPL NGRLVYLNEQ SSPSPTPRLR IPRVGPV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)