AT5G03280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.719 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NRAMP metal ion transporter family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Involved in ethylene signal transduction. Acts downstream of CTR1. Positively regulates ORE1 and negatively regulates mir164A,B,C to regulate leaf senescence. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ETHYLENE INSENSITIVE 2 (EIN2); FUNCTIONS IN: transporter activity; INVOLVED IN: in 22 processes; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Natural resistance-associated macrophage protein (InterPro:IPR001046), Ethylene-insensitive 2 (InterPro:IPR017187); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: natural resistance-associated macrophage protein 1 (TAIR:AT1G80830.1); Has 4402 Blast hits to 4259 proteins in 1453 species: Archae - 50; Bacteria - 3021; Metazoa - 376; Fungi - 278; Plants - 375; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 302 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:788589..793066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 140964.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1294 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MEAEIVNVRP QLGFIQRMVP ALLPVLLVSV GYIDPGKWVA NIEGGARFGY DLVAITLLFN FAAILCQYVA ARISVVTGKH LAQICNEEYD KWTCMFLGIQ 0101: AEFSAILLDL TMVVGVAHAL NLLFGVELST GVFLAAMDAF LFPVFASFLE NGMANTVSIY SAGLVLLLYV SGVLLSQSEI PLSMNGVLTR LNGESAFALM 0201: GLLGASIVPH NFYIHSYFAG ESTSSSDVDK SSLCQDHLFA IFGVFSGLSL VNYVLMNAAA NVFHSTGLVV LTFHDALSLM EQVFMSPLIP VVFLMLLFFS 0301: SQITALAWAF GGEVVLHDFL KIEIPAWLHR ATIRILAVAP ALYCVWTSGA DGIYQLLIFT QVLVAMMLPC SVIPLFRIAS SRQIMGVHKI PQVGEFLALT 0401: TFLGFLGLNV VFVVEMVFGS SDWAGGLRWN TVMGTSIQYT TLLVSSCASL CLILWLAATP LKSASNRAEA QIWNMDAQNA LSYPSVQEEE IERTETRRNE 0501: DESIVRLESR VKDQLDTTSV TSSVYDLPEN ILMTDQEIRS SPPEERELDV KYSTSQVSSL KEDSDVKEQS VLQSTVVNEV SDKDLIVETK MAKIEPMSPV 0601: EKIVSMENNS KFIEKDVEGV SWETEEATKA APTSNFTVGS DGPPSFRSLS GEGGSGTGSL SRLQGLGRAA RRHLSAILDE FWGHLYDFHG QLVAEARAKK 0701: LDQLFGTDQK SASSMKADSF GKDISSGYCM SPTAKGMDSQ MTSSLYDSLK QQRTPGSIDS LYGLQRGSSP SPLVNRMQML GAYGNTTNNN NAYELSERRY 0801: SSLRAPSSSE GWEHQQPATV HGYQMKSYVD NLAKERLEAL QSRGEIPTSR SMALGTLSYT QQLALALKQK SQNGLTPGPA PGFENFAGSR SISRQSERSY 0901: YGVPSSGNTD TVGAAVANEK KYSSMPDISG LSMSARNMHL PNNKSGYWDP SSGGGGYGAS YGRLSNESSL YSNLGSRVGV PSTYDDISQS RGGYRDAYSL 1001: PQSATTGTGS LWSRQPFEQF GVAERNGAVG EELRNRSNPI NIDNNASSNV DAEAKLLQSF RHCILKLIKL EGSEWLFGQS DGVDEELIDR VAAREKFIYE 1101: AEAREINQVG HMGEPLISSV PNCGDGCVWR ADLIVSFGVW CIHRVLDLSL MESRPELWGK YTYVLNRLQG VIDPAFSKLR TPMTPCFCLQ IPASHQRASP 1201: TSANGMLPPA AKPAKGKCTT AVTLLDLIKD VEMAISCRKG RTGTAAGDVA FPKGKENLAS VLKRYKRRLS NKPVGMNQDG PGSRKNVTAY GSLG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)